Application of MALDI-TOF MS to Rapid Identification of Streptomyces Application of MALDI-TOF MS to Rapid Identification of Streptomyces

Main Article Content

Apinya Bunkhean
วิทวัส แจ้งเอี่ยม
มารุต ตั้งวัฒนาชุลีพร

Abstract

This study aimed to describe the use of MALDI-TOF MS for the rapid identification of Streptomyces isolates from the durian orchard in Chanthaburi province, Thailand. Twelve Streptomyces were taxonomically studied based on their phenotypic characteristics. Firstly colonies are relatively smooth surfaced but later they develop a weft of aerial mycelium that may appear floccose, powdery, or velvety. The results shown that 12 isolates were rapidly identified (<15 minutes) with high scores between 1.72 to 2.56. Twelve isolates were identified as S. matensis, S. albogriseolus, S. matensis, S. cavourensis, S, albidoflavus, S. albidoflavus, S. cavourensis, S. cavourensis, S. cavourensis, S. viridodiastaticus, S. griseoincarnatus, S. cavourensis (Score value are 1.72, 1.79, 2.28, 2.23, 2.13, 2.28, 2.60, 2.06, 2.17, 1.77, 1.75 and 2.56 respectively). These results indicate that MALDI-TOF MS could be used as a cost–effective tool for rapid identification of Streptomyces isolates.

Article Details

How to Cite
Bunkhean, A., แจ้งเอี่ยม ว. ., & ตั้งวัฒนาชุลีพร ม. . (2023). Application of MALDI-TOF MS to Rapid Identification of Streptomyces : Application of MALDI-TOF MS to Rapid Identification of Streptomyces . วารสารเกษตรรำไพ, 1(1), 1–7. retrieved from https://ph03.tci-thaijo.org/index.php/kaset_rbruj/article/view/443
Section
Research Article

References

ชีวาพร สุขดี. (2565). แผนธุรกิจผลิตภัณฑ์สารสกัดชีวภาพควบคุมโรคพืช BIONAR. สารนิพนธ์หลักสูตรปริญญาการจัดการ

มหาบัณฑิตวิทยาลัยการจัดการ มหาวิทยาลัยมหิดล.

สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 6 กรมวิชาการเกษตร. (2565). เทคโนโลยีผสมผสานการป้องกันกำจัดโรครากเน่าโคนเน่า

ทุเรียน ภาคตะวันออก. คณะทำงานจัดการความรู้ สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 6.

สุธาสินี อั้งสูงเนิน. (2558). ผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมจากการใช้สารเคมีกำจัดศัตรูพืช. วารสารวิชาการมหาวิทยาลัยอีสเทิร์นเอเชีย

ฉบับวิชาการและเทคโนโลยี. 9(1): 50-63.

Amin, H,. Ashraf, K. and Khosrow, I. (2014). Streptomycetes: Characteristics and their antimicrobial activities.

International journal of Advanced Biological and Biomedical Research, 2(1): 63-75.

Bruker Daltonics. Bruker guide to MALDI sample preparation – MALDI preparation protocols, edition 5, 2017.

Bruker Daltonics, Germany.

Cayrou, C., Raoult, D. and Drancourt, M. (2010). Matrix-assisted laser desorption/ionization time of-flight mass

spectrometry for the identification of environmental organisms: the Planctomycetes paradigm.

Environmental Microbiology Reports, 2: 752–60.

Ghanem, G.A.M., Gebily, D.A.S., Ragab, M.M., Ali, A.M., Soliman, N.E.D. and Abd El-Moity, T.H. (2022). Efficacy of

antifungal substances of three Streptomyces spp. against different plant pathogenic fungi. Egyptian

Journal of Biological Pest Control 32: 112, doi: 10.1186/s41938-022-00612-9.

González, V., Vargas-Straube, M.J., Beys-da-Silva, W.O., Santi, L., Valencia, P., Beltrametti, F. and Cámara, B.,

(2022). Enzyme bioprospection of marine-derived actinobacteria from the Chilean coast and new

insight in the mechanism of keratin degradation in Streptomyces sp. G11C. Marine Drugs, 18(11): 537,

doi: 10.3390/md18110537.

Kim, K.O., Shin, K.S., Kim, M.N., Shin, K.S., Labeda, D.P., Han, J.H. and Kim, H.B. (2012). Reassessment of the

status of Streptomyces setonii and reclassification of Streptomyces fimicarius as a later synonym of

Streptomyces setonii and Streptomyces albovinaceus as a later synonym of Streptomyces

globisporus based on combined 16S rRNA/gyrB gene sequence analysis. International Journal of

Systematic and Evolutionary Microbiology, 62: 2978–85.

Loucif, L., Bendjama, E., Gacemi-Kirane, D. and Rolain, J.M. (2014). Rapid identification of Streptomyces isolates

by MALDI-TOF MS. Microbiological Research, 169(12): 940-7.

Seng, P., Abat, C., Rolain, J.M., Colson, P., Lagier, J.C., Gouriet, F., Fournier, P.E., Drancourt, M. Scola, B.L.

and Raoult, D. (2013). Identification of rare pathogenic bacteria in a clinical microbiology laboratory:

impact of matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Journal of

Clinical Microbiology, 51: 2182–94.