การประยุกต์ใช้ MALDI-TOF MS ในการระบุชนิดของ Streptomyces อย่างรวดเร็ว Application of MALDI-TOF MS to Rapid Identification of Streptomyces
Article Sidebar
Main Article Content
บทคัดย่อ
การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่ออธิบายการใช้งาน MALDI-TOF MS ในการจำแนกชนิดของ Streptomyces ซึ่งแยกได้จากสวนทุเรียน ในจังหวัดจันทบุรี ประเทศไทย อย่างรวดเร็ว โดย Streptomyces จำนวน 12 ไอโซเลท คัดเลือกโดยศึกษาทางอนุกรมวิธานตามลักษณะฟีโนไทป์ โดยในระยะแรกโคโลนีมักมีลักษณะเรียบ จากนั้นจะมีการพัฒนาเส้นใยอากาศ ผิวโคโลนีย่น บางโคโลนีมีลักษณะเป็นผง หรือกำมะหยี่ เมื่อนำไปจำแนกด้วย MALDI-TOF MS พบว่า ทั้ง 12 ไอโซเลทถูกจำแนกชนิดได้อย่างรวดเร็ว (<15 นาที) ซึ่งมีค่าคะแนนระหว่าง 1.72 ถึง 2.56 และระบุว่าเป็น S. matensis, S. albogriseolus, S. matensis, S. cavourensis, S. albidoflavus, S. albidoflavus, S. cavourensis, S. cavourensis, S. cavourensis, S. viridodiastaticus, S. griseoincarnatus, S. cavourensis (ค่าคะแนน ได้แก่ 1.72, 1.79, 2.28, 2.23, 2.13, 2.28, 2.60, 2.06, 2.17, 1.77, 1.75 และ 2.56 ตามลำดับ) จากผลการศึกษาบ่งชี้ว่า MALDI-TOF MS เป็นเครื่องมือที่คุ้มค่า ในการใช้จำแนกชนิดของ Streptomyces ได้อย่างรวดเร็ว
Article Details
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
References
ชีวาพร สุขดี. (2565). แผนธุรกิจผลิตภัณฑ์สารสกัดชีวภาพควบคุมโรคพืช BIONAR. สารนิพนธ์หลักสูตรปริญญาการจัดการ
มหาบัณฑิตวิทยาลัยการจัดการ มหาวิทยาลัยมหิดล.
สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 6 กรมวิชาการเกษตร. (2565). เทคโนโลยีผสมผสานการป้องกันกำจัดโรครากเน่าโคนเน่า
ทุเรียน ภาคตะวันออก. คณะทำงานจัดการความรู้ สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 6.
สุธาสินี อั้งสูงเนิน. (2558). ผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมจากการใช้สารเคมีกำจัดศัตรูพืช. วารสารวิชาการมหาวิทยาลัยอีสเทิร์นเอเชีย
ฉบับวิชาการและเทคโนโลยี. 9(1): 50-63.
Amin, H,. Ashraf, K. and Khosrow, I. (2014). Streptomycetes: Characteristics and their antimicrobial activities.
International journal of Advanced Biological and Biomedical Research, 2(1): 63-75.
Bruker Daltonics. Bruker guide to MALDI sample preparation – MALDI preparation protocols, edition 5, 2017.
Bruker Daltonics, Germany.
Cayrou, C., Raoult, D. and Drancourt, M. (2010). Matrix-assisted laser desorption/ionization time of-flight mass
spectrometry for the identification of environmental organisms: the Planctomycetes paradigm.
Environmental Microbiology Reports, 2: 752–60.
Ghanem, G.A.M., Gebily, D.A.S., Ragab, M.M., Ali, A.M., Soliman, N.E.D. and Abd El-Moity, T.H. (2022). Efficacy of
antifungal substances of three Streptomyces spp. against different plant pathogenic fungi. Egyptian
Journal of Biological Pest Control 32: 112, doi: 10.1186/s41938-022-00612-9.
González, V., Vargas-Straube, M.J., Beys-da-Silva, W.O., Santi, L., Valencia, P., Beltrametti, F. and Cámara, B.,
(2022). Enzyme bioprospection of marine-derived actinobacteria from the Chilean coast and new
insight in the mechanism of keratin degradation in Streptomyces sp. G11C. Marine Drugs, 18(11): 537,
doi: 10.3390/md18110537.
Kim, K.O., Shin, K.S., Kim, M.N., Shin, K.S., Labeda, D.P., Han, J.H. and Kim, H.B. (2012). Reassessment of the
status of Streptomyces setonii and reclassification of Streptomyces fimicarius as a later synonym of
Streptomyces setonii and Streptomyces albovinaceus as a later synonym of Streptomyces
globisporus based on combined 16S rRNA/gyrB gene sequence analysis. International Journal of
Systematic and Evolutionary Microbiology, 62: 2978–85.
Loucif, L., Bendjama, E., Gacemi-Kirane, D. and Rolain, J.M. (2014). Rapid identification of Streptomyces isolates
by MALDI-TOF MS. Microbiological Research, 169(12): 940-7.
Seng, P., Abat, C., Rolain, J.M., Colson, P., Lagier, J.C., Gouriet, F., Fournier, P.E., Drancourt, M. Scola, B.L.
and Raoult, D. (2013). Identification of rare pathogenic bacteria in a clinical microbiology laboratory:
impact of matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Journal of
Clinical Microbiology, 51: 2182–94.